バージョン2.6.1.3の時点で、CSVインポートでエントリーのタグ情報を入力させることはできません。

Movable Type形式、WordPress形式でのインポートであれば可能です。こちらを利用するか、カスタムフィールドグループでのインポートを検討してください。

csvインポートでエントリーのタグも入力できますか? | a-blog cmsフォーラム